Nuevo chip de ADN para la leucemia linfática crónica

La leucemia linfática crónica (LLC) es la forma más frecuente de leucemia en los países occidentales / Imagen: Clínic

Desarrollado un chip de ADN para detectar y guiar mejor el tratamiento de la leucemia linfática crónica

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Un equipo de investigadores del Instituto de Investigaciones Biomédicas August Pi i Sunyer (IDIBAPS) y el Hospital Clínic de Barcelona, en colaboración con qGenomics, ha desarrollado un chip de ADN (o array) que permite analizar el genoma y determinar anomalías genéticas en la leucemia linfática crónica. Este chip permite superar las limitaciones en cuanto a la detección de alteraciones de las técnicas empleadas hasta ahora, como la hibridación in situ fluorescente (FISH), y puede ser utilizada para un diagnóstico más preciso de la enfermedad.

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Hospital Clínic / La leucemia linfática crónica (LLC) es la forma más frecuente de leucemia en los países occidentales. Una enfermedad común que afecta a una de cada 20.000 personas de 50 años, y alcanza a una de cada 3.300 en personas de más de 80 años. Diversas alteraciones cromosómicas recurrentes se asocian con el pronóstico y pueden guiar una terapia adaptada al riesgo que la enfermedad representa en cada caso.

El array permitió detectar ciertas alteraciones y un nivel de complejidad genómica que no hubiera sido posible detectar mediante la técnica FISH rutinaria

En el estudio, publicado en la revista Genes, Chromosomes & Cancer, se hibridaron el ADN de 180 pacientes con LLC con el nuevo arrayqChip®Hemo, que contiene una alta densidad de sondas para cubrir las regiones frecuentemente alteradas en LLC. “En general, el 86% de los casos presentaron alteraciones cromosómicas. Hubo una elevada concordancia de los resultados del array con el FISH, y todas las discrepancias correspondieron a alteraciones muy subclonales detectadas sólo por FISH”, explica el Dr. Lluís Armengol, director científico de qGenomics.

El array permitió detectar ciertas alteraciones y un nivel de complejidad genómica que no hubiera sido posible detectar mediante la técnica FISH rutinaria. “Algunas de estas alteraciones están relacionadas con la necesidad de tratamiento o bien con un peor pronóstico, por lo que la información obtenida podría ser útil para seleccionar una terapia más adecuada para cada paciente“, señala la Dra. Silvia Beà, investigadora del equipo Oncomorfología Humana y Funcional del IDIBAPS y coordinadora del estudio.

Este trabajo es el resultado de una colaboración estrecha y estable entre los investigadores de IDIBAPS y la empresa qGenomics y supone la primera prueba de que este array específico podría ser empleado para el diagnóstico de la LLC. Detecta con precisión, en mucho menos tiempo y en un solo experimento, todas las alteraciones relevantes en cuanto al número de copias, la complejidad genómica, eventos de cromotripsis – roturas masivas y reordenamientos de los cromosomas – no cubiertas por el panel de FISH. “Esta prueba puede ser utilizada como una herramienta práctica para estratificar los pacientes con LLC para el diagnóstico de rutina o en ensayos clínicos. Hemos demostrado que los datos del arrayqChip®Hemo son concordantes con FISH. Y, por otra parte, que este array puede detectar otras alteraciones (no cubiertas por FISH) con significado pronóstico y también patrones de reordenamientos complejos “, concluye el Dr. Armengol.

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Referencia del artículo:

Detection of chromothripsis-like patterns with a custom array platform for chronic lymphocytic leukemia.

Salaverria I, Martín-Garcia D, López C, Clot G, García-Aragonés M, Navarro A, Delgado J, Baumann T, Pinyol M, Martin-Guerrero I, Carrió A, Costa D, Queirós AC, Jayne S, Aymerich M, Villamor N, Colomer D, González M, López-Guillermo A, Campo E, Dyer MJ, Siebert R, Armengol L, Beà S.

Genes Chromosomes Cancer. 2015 Aug 25. doi: 10.1002/gcc.22277. [Epub ahead of print]

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